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與蛋白質(zhì)相關(guān)的三種計(jì)算解題策略

時(shí)間: 若木631 分享
  與蛋白質(zhì)相關(guān)的計(jì)算題,題型較多,難度較大。但總體上可分為三種類型,且每類題型都有相應(yīng)的解題策略。如下表:
題目類型 解題策略
有關(guān)蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量、氨基酸數(shù)、氨基數(shù)、羧基數(shù)、肽鏈數(shù)、肽鍵數(shù)、脫水?dāng)?shù)的計(jì)算 列方程求解
蛋白質(zhì)(或多肽)中原子數(shù)計(jì)算 用原子守恒解答
多肽種類計(jì)算 用數(shù)學(xué)中“排列組合”解答
  1.蛋白質(zhì)中氨基酸、氨基、羧基、肽鏈、肽鍵、脫水?dāng)?shù)及蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量的計(jì)算

  [方法依據(jù)] 可將肽鏈看作“C”與“—CO—NH—”交替連接構(gòu)成的基本骨架,在“C”上連接著R基和H,在肽鏈的兩端分別是游離的“—NH2”和“—COOH”,如下圖所示:

  [妙法指津] 結(jié)合上面的示意圖,可以得出如下規(guī)律:

  (1)縮合時(shí)脫去的水分子數(shù)=肽鍵數(shù)=氨基酸數(shù)-肽鏈數(shù)。

  (2)蛋白質(zhì)中氨(羧)基數(shù)=肽鏈數(shù)+R基上的氨(羧)基數(shù)=各氨基酸中氨(羧)基的總數(shù)-肽鍵數(shù)。

  注意 如果不考慮R基上的氨(羧)基數(shù),一條多肽鏈中,至少含有一個(gè)游離氨(羧)基;若蛋白質(zhì)分子由多條肽鏈構(gòu)成,則至少含有的氨(羧)基數(shù)等于肽鏈數(shù)。

  (3)蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量=氨基酸總相對(duì)分子質(zhì)量(氨基酸個(gè)數(shù)×氨基酸平均相對(duì)分子質(zhì)量)-失水量(18×脫去的水分子數(shù))。

  注意 有時(shí)還要考慮其他化學(xué)變化過程,如肽鏈上出現(xiàn)二硫鍵(—S—S—)時(shí),要再減去2(即兩個(gè)H)。

  (4)若為環(huán)狀多肽,則可將公式中的肽鏈數(shù)視為零,再進(jìn)行相關(guān)計(jì)算。

  [典例剖析] 已知氨基酸的平均相對(duì)分子質(zhì)量為128,測(cè)得某蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量為5 646,則組成該蛋白質(zhì)的氨基酸數(shù)、肽鏈數(shù)以及至少游離的氨基數(shù)分別為 (  )

  A.51、1、51 B.51、2、2

  C.51、2、51 D.44、2、2

  解析 解題時(shí)可采用“列方程求解”的方法。設(shè)氨基酸數(shù)為n,肽鏈數(shù)為x,則n×128=5 646+(n-x)×18,化簡(jiǎn)得110n+18x=5 646。當(dāng)x=1時(shí),n≈51.16;當(dāng)x=2時(shí),n=51。因此只有B、C項(xiàng)的數(shù)值符合氨基酸數(shù)和肽鏈數(shù)。又知兩條肽鏈上至少游離著2個(gè)氨基,故B項(xiàng)正確。

  答案 B

  2.多肽中各原子數(shù)的計(jì)算

  [方法依據(jù)] 氨基酸的結(jié)構(gòu)通式是解答此類題目的突破口。在一個(gè)氨基酸中,若不考慮R基,至少含有2個(gè)碳原子、2個(gè)氧原子、4個(gè)氫原子和1個(gè)氮原子。而脫水縮合形成多肽時(shí),要失去部分水分子,但是碳原子、氮原子的數(shù)目不會(huì)減少。

  [妙法指津] (1)碳原子數(shù)=氨基酸的分子數(shù)×2+R基上的碳原子數(shù)。

  (2)氫原子數(shù)=各氨基酸中氫原子的總數(shù)-脫去的水分子數(shù)×2。

  (3)氧原子數(shù)=各氨基酸中氧原子的總數(shù)-脫去的水分子數(shù)。

  (4)氮原子數(shù)=肽鏈數(shù)+肽鍵數(shù)+R基上的氮原子數(shù)=各氨基酸中氮原子的總數(shù)。

  (5)由于R基上的碳原子數(shù)不好確定,且氫原子數(shù)較多,因此以氮原子數(shù)或氧原子數(shù)的計(jì)算為突破口,計(jì)算氨基酸的分子式或氨基酸個(gè)數(shù)最為簡(jiǎn)便。

  [典例剖析] 某多肽鏈為199肽,其分子式為CxHyNaObS2(a>199、b>200),并且由下列5種氨基酸組成。那么該多肽徹底水解后將會(huì)分別得到賴氨酸、天冬氨酸的個(gè)數(shù)為

  (  )

  A.a-199、(b-200)/2 B.a-200、b-200

  C.a-199、(b-199)/2 D.a-200、(b-200)/2

  解析 由題意知該多肽為199肽,則它是由199個(gè)氨基酸組成的;又知該多肽分子式為CxHyNaObS2,其中N有a個(gè),則可知組成該多肽的199個(gè)氨基酸共有a個(gè)氨基;又知組成該多肽的5種氨基酸中只有賴氨酸含有2個(gè)氨基,所以賴氨酸個(gè)數(shù)為a—199。由于組成該多肽的5種氨基酸中只有天冬氨酸含有2個(gè)羧基,設(shè)該多肽共含有d個(gè)天冬氨酸,反應(yīng)前199個(gè)氨基酸中氧原子共有4d+(199-d)×2,形成199肽時(shí)脫去198個(gè)水分子,每個(gè)水分子含一個(gè)氧原子,所以該多肽分子中尚存在氧原子數(shù)為b=4d+(199-d)×2-198=2d+200,d=(b-200)/2。

  答案 A

  3.多肽種類的計(jì)算

  [方法依據(jù)] 多肽的不同取決于氨基酸的數(shù)目、種類和排列順序。對(duì)于氨基酸數(shù)目相同的多肽來說,則取決于氨基酸的種類和排列順序??梢越柚旅娴氖疽鈭D(?代表要安放的氨基酸的位置),結(jié)合數(shù)學(xué)中“排列組合”的相關(guān)知識(shí),推導(dǎo)出相關(guān)的計(jì)算規(guī)律。(以20種氨基酸形成的四肽化合物為例)

  [妙法指津] (1)若每種氨基酸數(shù)目無限(允許重復(fù))的情況下,可形成肽類化合物的種類有204種(即1號(hào)位置安放氨基酸的情況有20種,2、3、4號(hào)也是如此,即20×20×20×20=204種)。

  (2)若每種氨基酸只有一個(gè)(不允許重復(fù))的情況下,可形成肽類化合物的種類有(20×19×18×17)種[即1號(hào)位置安放氨基酸的情況有20種,2號(hào)位置安放的氨基酸只能在剩余的19種中選擇……即(20×19×18×17)種]。

  [典例剖析] 現(xiàn)有足量的甘氨酸、丙氨酸、谷氨酸3種氨基酸,它們能形成的三肽種類以及包含3種氨基酸的三肽種類分別最多有 (  )

  A.9種,9種 B.6種,3種

  C.18種,6種 D.27種,6種

  解析 由上述“妙法指律中的(1)”很容易計(jì)算出足量的3種氨基酸構(gòu)成的三肽有33=27種。對(duì)于包含3種氨基酸的三肽種類的理解,可借用示意圖“?—?—?”來分析,即第一個(gè)位置的氨基酸有3種情況,第二個(gè)位置只能從另外2種氨基酸中任選1種,第三個(gè)位置只能安放剩余的1種,雖然這3種氨基酸足量,但是仍需按“妙法指律中的(2)”計(jì)算,即3×2×1=6種。

  答案 D

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